Basato su un processore Qualcomm Snapdragon 680, Huawei nova 9 SE è completato da un sistema di raffreddamento al grafene, altrettanto potente, in un'architettura a sandwich che è in grado di rilevare e raffreddare più rapidamente le aree surriscaldate.
A proposito di fotocamere, nova 9 se integra il sistema AI Quad Camera da 108MP che comprende una fotocamera principale da 108MP, un obiettivo ultra-grandangolare da 8MP, un obiettivo Bokeh da 2MP e un obiettivo macro da 2MP.