Ventuno anni dopo l’uscita del primo film della serie Matrix, Lilly Wachowski, che ha diretto le pellicole con la sorella Lana, ha confermato le teorie che vedrebbero il film come una grande allegoria transgender.
Durante una video intervista per Netflix Lilly Wachowski avrebbe parlato apertamente della narrativa transgender implicita nella trilogia, spiegando come lei e la sorella, entrambe donne transgender, abbiano realizzato il proprio coming out attraverso la narrazione della storia di fantascienza.