Sebbene la recente collection celebrativa per festeggiare i 35 anni di Super Mario sia stata accolta con estremo entusiasmo da parte dei giocatori, qualche critica a Super Mario 3D All-Stars è stata mossa.
comlns E1g5SlL L’assenza dei controlli invertiti non solo è stata una mancanza abbastanza criticata da alcuni giocatori, ma sono stati ritenuti anche una delle più grandi omissioni in Super Mario 3D All-Stars al momento del lancio, specialmente per il tanto atteso ritorno di Super Mario Sunshine, che fin dalla sua prima apparizione su GameCube capovolgeva i controlli di mira rispetto alla versione originale e non permetteva ai giocatori di cambiarli.