L’evoluzione di Deep Space Nine fu tale che vennero affrontati elementi narrativi finora tenuti lontani da Star Trek, come l’influenza della religione e la perfidia dell’animo umano o la caratterizzazione delle malattie mentali e il lato meno nobile della guerra.
Al momento della nascita di Deep Space Nine, The Next Generation era ancora in programmazione, e si ebbe la sensazione che due serie in contemporanea su un’astronave in viaggio nello spazio non fosse un’idea molto intelligente, come spiegò in seguito Rick Berman “C’erano due anni di sovrapposizione tra Deep Space Nine e The Next Generation, non potevamo creare un’ulteriore serie ambientata su un’astronave.