Kamui Kobayashi ha invece piazzato la Toyota #7 in terza posizione con un ritardo di 0"417 dai compagni di squadra, ricordando però che la LMP1 del giapponese, Mike Conway e "Pechito" Lopez è anche la monoposto più penalizzata per via del nuovo sistema di handicap adottato dal WEC.
Al termine dei primi 90' di sessione in Giappone, la TS050 Hybrid di Sébastien Buemi, Kazuki Nakajima e Brendon Hartley ha siglato il miglior crono in 1'27"373 (grazie alla prestazione dello svizzero), precedendo per 0"286 la R13 condotta da Norman Nato, che condivide il volante con Gustavo Menezes e Bruno Senna.