Lorenzo Ornaghi, ex rettore della Cattolica nonché ex ministro della cultura del governo Monti, è stato anche designnato presidente del nuovo cda.
Il Museo è gestito dal 2001 da una Fondazione di diritto privato a partecipazione pubblica non di controllo.
I Partecipanti sostenitori – Regione Lombardia, Comune di Milano, Camera di Commercio di Milano hanno scelto invece la nuova vicedirettrice, la professoressa della Bocconi Paola Dubini, oltre ad Antonio Calbi (nel cda della Triennale), e Gianfelice Rocca (ex presidente di Assolombarda).