I fossili di Kongonaphon furono scoperti in Madagascar nel 1998 da un team composto da ricercatori americani e malgasci, guidato da John Flynn, attualmente curatore del Museo di Storia naturale Frick di New York, che all’epoca lavorava al The Field Museum di Chicago, affiancato da Andre Wyss, dell’Università della California, e da ricercatori e studenti “La scoperta di questo piccolo parente di dinosauri e pterosauri sottolinea l’importanza della documentazione fossile che ha il Madagascar nella storia dei vertebrati durante periodi poco studiati in altri luoghi”, assicura la professoressa Lovasoa Ranivoharimanana, docente di Paleontologia dei vertebrati presso l’Università di Antananarivo.