Il finale del film non è stato però l’unico elemento ad essere stato ritoccato, anche il comparto degli effetti visivi ha dovuto modificare gli effetti speciali della trasformazione di Jean in Fenice, passando da un effetto infuocato a qualcosa di più cosmico e ultraterreno.
Dark Phoenix avesse subito consistenti reshoot, al fine di cambiare le sequenze finali della pellicola.