L'impiego del secondo livello dello strumento Pulizia disco, invece, richiede i diritti di amministratore perché - cliccando sul pulsante Pulizia file di sistema - consente di esaminare quali elementi, ricollegabili al funzionamento di Windows, continuano a occupare spazio.
Dall'utilità Pulizia disco, premendo il pulsante Pulizia file di sistema si otterrà la lista completa degli elementi che occupano spazio e che possono essere eventualmente rimossi.